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中国猪瘟病毒分离株的系统发育分析

2021-09-27 1642人阅读 来源:
猪瘟(Classical swine fever, CSF)是由猪瘟病毒(Classical swine fever virus, CSFV)引起的一种严重疾病,在世界范围内给养猪业造成了巨大经济损失。在中国,自1954年以来,通过广泛的疫苗接种,CSF得到了有效控制。然而,在中国仍有零星的CSF暴发。

2011-2018年从中国3个省份(陕西、甘肃、宁夏)分离到27株CSFV。基于包膜糖蛋白E2编码区全长的系统发育分析表明,27株CSFV分离株中有25株聚集在2.1亚群和2.2亚群,而来自甘肃的2株分离株属于1.1亚群。27株分离株核苷酸序列同源性为79.3% ~ 99.8%,氨基酸序列同源性为83.1% ~ 99.7%。基于E2氨基酸序列的进一步分析表明,这些新分离株有一些相同的氨基酸被取代,如R31K和N34S。